Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms