Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 AC007966.1-201ENST00000421998 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 AL513283.1-201ENST00000441790 1087 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 AC253576.1-201ENST00000511645 1156 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 AP001830.1-201ENST00000528717 692 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 HTR4-207ENST00000520514 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 AP001442.1-203ENST00000596385 876 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHF12Q96QT6 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms