Protein–RNA interactions for Protein: Q96QE5

TEFM, Transcription elongation factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TEFMQ96QE5 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TEFMQ96QE5 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms