Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GBP4Q96PP9 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBP4Q96PP9 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms