Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC7Q96M83 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC7Q96M83 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms