Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DCHS1Q96JQ0 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms