Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ABCC12Q96J65 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms