Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGF29Q96ES7 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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