Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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FAM3DQ96BQ1 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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FAM3DQ96BQ1 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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FAM3DQ96BQ1 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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FAM3DQ96BQ1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM3DQ96BQ1 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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