Protein–RNA interactions for Protein: Q92879

CELF1, CUGBP Elav-like family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF1Q92879 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CELF1Q92879 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CELF1Q92879 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms