Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TOPBP1Q92547 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TOPBP1Q92547 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TOPBP1Q92547 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TOPBP1Q92547 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TOPBP1Q92547 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TOPBP1Q92547 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TOPBP1Q92547 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TOPBP1Q92547 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TOPBP1Q92547 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TOPBP1Q92547 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TOPBP1Q92547 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TOPBP1Q92547 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TOPBP1Q92547 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TOPBP1Q92547 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TOPBP1Q92547 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TOPBP1Q92547 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TOPBP1Q92547 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TOPBP1Q92547 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TOPBP1Q92547 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TOPBP1Q92547 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TOPBP1Q92547 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
TOPBP1Q92547 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
TOPBP1Q92547 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TOPBP1Q92547 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
TOPBP1Q92547 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TOPBP1Q92547 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
TOPBP1Q92547 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TOPBP1Q92547 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TOPBP1Q92547 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TOPBP1Q92547 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TOPBP1Q92547 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TOPBP1Q92547 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TOPBP1Q92547 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TOPBP1Q92547 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TOPBP1Q92547 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TOPBP1Q92547 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TOPBP1Q92547 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TOPBP1Q92547 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TOPBP1Q92547 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TOPBP1Q92547 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
TOPBP1Q92547 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TOPBP1Q92547 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TOPBP1Q92547 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TOPBP1Q92547 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TOPBP1Q92547 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TOPBP1Q92547 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TOPBP1Q92547 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TOPBP1Q92547 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms