Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCSTNQ92542 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms