Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR3

SPTSSB, Serine palmitoyltransferase small subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSBQ8NFR3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 TBCD-201ENST00000355528 7168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 AC090114.2-201ENST00000608477 7054 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SPTSSBQ8NFR3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SPTSSBQ8NFR3 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SPTSSBQ8NFR3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SPTSSBQ8NFR3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SPTSSBQ8NFR3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SPTSSBQ8NFR3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SPTSSBQ8NFR3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SPTSSBQ8NFR3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
SPTSSBQ8NFR3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SPTSSBQ8NFR3 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SPTSSBQ8NFR3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SPTSSBQ8NFR3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SPTSSBQ8NFR3 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SPTSSBQ8NFR3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SPTSSBQ8NFR3 PLB1-205ENST00000422425 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SPTSSBQ8NFR3 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SPTSSBQ8NFR3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SPTSSBQ8NFR3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SPTSSBQ8NFR3 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SPTSSBQ8NFR3 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SPTSSBQ8NFR3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SPTSSBQ8NFR3 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SPTSSBQ8NFR3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SPTSSBQ8NFR3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SPTSSBQ8NFR3 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SPTSSBQ8NFR3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SPTSSBQ8NFR3 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SPTSSBQ8NFR3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SPTSSBQ8NFR3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SPTSSBQ8NFR3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms