Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NUP35Q8NFH5 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NUP35Q8NFH5 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NUP35Q8NFH5 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NUP35Q8NFH5 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NUP35Q8NFH5 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NUP35Q8NFH5 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NUP35Q8NFH5 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NUP35Q8NFH5 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NUP35Q8NFH5 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NUP35Q8NFH5 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NUP35Q8NFH5 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NUP35Q8NFH5 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NUP35Q8NFH5 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NUP35Q8NFH5 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NUP35Q8NFH5 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NUP35Q8NFH5 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NUP35Q8NFH5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NUP35Q8NFH5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NUP35Q8NFH5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NUP35Q8NFH5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NUP35Q8NFH5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NUP35Q8NFH5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NUP35Q8NFH5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NUP35Q8NFH5 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NUP35Q8NFH5 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NUP35Q8NFH5 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NUP35Q8NFH5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NUP35Q8NFH5 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NUP35Q8NFH5 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NUP35Q8NFH5 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NUP35Q8NFH5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NUP35Q8NFH5 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NUP35Q8NFH5 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NUP35Q8NFH5 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NUP35Q8NFH5 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NUP35Q8NFH5 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NUP35Q8NFH5 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NUP35Q8NFH5 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NUP35Q8NFH5 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NUP35Q8NFH5 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NUP35Q8NFH5 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NUP35Q8NFH5 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NUP35Q8NFH5 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NUP35Q8NFH5 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NUP35Q8NFH5 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NUP35Q8NFH5 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NUP35Q8NFH5 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NUP35Q8NFH5 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NUP35Q8NFH5 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NUP35Q8NFH5 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NUP35Q8NFH5 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NUP35Q8NFH5 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NUP35Q8NFH5 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NUP35Q8NFH5 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NUP35Q8NFH5 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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NUP35Q8NFH5 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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NUP35Q8NFH5 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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NUP35Q8NFH5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NUP35Q8NFH5 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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