Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF548Q8NEK5 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms