Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC00612Q8N6U2 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00612Q8N6U2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms