Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SVOPQ8N4V2 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms