Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KRT28Q7Z3Y7 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT28Q7Z3Y7 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms