Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSX7Q7RTT5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SSX7Q7RTT5 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSX7Q7RTT5 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSX7Q7RTT5 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SSX7Q7RTT5 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSX7Q7RTT5 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSX7Q7RTT5 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSX7Q7RTT5 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSX7Q7RTT5 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSX7Q7RTT5 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSX7Q7RTT5 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSX7Q7RTT5 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSX7Q7RTT5 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSX7Q7RTT5 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSX7Q7RTT5 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SSX7Q7RTT5 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSX7Q7RTT5 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSX7Q7RTT5 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSX7Q7RTT5 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSX7Q7RTT5 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSX7Q7RTT5 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSX7Q7RTT5 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SSX7Q7RTT5 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SSX7Q7RTT5 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSX7Q7RTT5 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSX7Q7RTT5 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SSX7Q7RTT5 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSX7Q7RTT5 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SSX7Q7RTT5 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSX7Q7RTT5 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SSX7Q7RTT5 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SSX7Q7RTT5 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SSX7Q7RTT5 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SSX7Q7RTT5 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSX7Q7RTT5 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSX7Q7RTT5 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSX7Q7RTT5 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSX7Q7RTT5 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSX7Q7RTT5 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSX7Q7RTT5 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSX7Q7RTT5 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSX7Q7RTT5 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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