Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CFAP47Q6ZTR5 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CFAP47Q6ZTR5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CFAP47Q6ZTR5 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CFAP47Q6ZTR5 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
CFAP47Q6ZTR5 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CFAP47Q6ZTR5 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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