Protein–RNA interactions for Protein: Q6XXX2

LINC00114, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00114, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00114Q6XXX2 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00114Q6XXX2 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms