Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXD4L3Q6VB84 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms