Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC4A10Q6U841 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms