Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOA5Q6Q788 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms