Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC41PQ6P2S7 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms