Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
ANKRD54Q6NXT1 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ANKRD54Q6NXT1 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms