Protein–RNA interactions for Protein: Q68D86

CCDC102B, Coiled-coil domain-containing protein 102B, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102BQ68D86 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC102BQ68D86 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms