Protein–RNA interactions for Protein: Q63HK3

ZKSCAN2, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 2, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN2Q63HK3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZKSCAN2Q63HK3 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms