Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0B7

TMEM236, Transmembrane protein 236, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM236Q5W0B7 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM236Q5W0B7 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM236Q5W0B7 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM236Q5W0B7 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM236Q5W0B7 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM236Q5W0B7 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM236Q5W0B7 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM236Q5W0B7 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM236Q5W0B7 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM236Q5W0B7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM236Q5W0B7 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM236Q5W0B7 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM236Q5W0B7 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM236Q5W0B7 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM236Q5W0B7 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM236Q5W0B7 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM236Q5W0B7 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM236Q5W0B7 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM236Q5W0B7 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM236Q5W0B7 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM236Q5W0B7 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM236Q5W0B7 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM236Q5W0B7 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM236Q5W0B7 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM236Q5W0B7 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM236Q5W0B7 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM236Q5W0B7 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM236Q5W0B7 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM236Q5W0B7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM236Q5W0B7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM236Q5W0B7 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM236Q5W0B7 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM236Q5W0B7 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM236Q5W0B7 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM236Q5W0B7 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM236Q5W0B7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM236Q5W0B7 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM236Q5W0B7 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM236Q5W0B7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM236Q5W0B7 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM236Q5W0B7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM236Q5W0B7 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM236Q5W0B7 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM236Q5W0B7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM236Q5W0B7 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM236Q5W0B7 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM236Q5W0B7 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM236Q5W0B7 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM236Q5W0B7 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM236Q5W0B7 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM236Q5W0B7 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM236Q5W0B7 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM236Q5W0B7 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM236Q5W0B7 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM236Q5W0B7 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM236Q5W0B7 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM236Q5W0B7 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM236Q5W0B7 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM236Q5W0B7 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM236Q5W0B7 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms