Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRCH2Q5VUJ6 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms