Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms