Protein–RNA interactions for Protein: Q5NE16

CTSL3P, Putative inactive cathepsin L-like protein CTSL3P, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSL3PQ5NE16 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSL3PQ5NE16 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms