Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVL4

EFHC1, EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1Q5JVL4 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFHC1Q5JVL4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms