Protein–RNA interactions for Protein: Q5H8C1

FREM1, FRAS1-related extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 2,179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FREM1Q5H8C1 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FREM1Q5H8C1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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