Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAVIN4Q5BKX8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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