Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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ANKRD39Q53RE8 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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ANKRD39Q53RE8 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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ANKRD39Q53RE8 KRTAP10-4-201ENST00000400374 1643 ntAPPRIS P2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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ANKRD39Q53RE8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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ANKRD39Q53RE8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD39Q53RE8 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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