Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms