Protein–RNA interactions for Protein: Q3YBR2

TBRG1, Transforming growth factor beta regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG1Q3YBR2 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TBRG1Q3YBR2 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TBRG1Q3YBR2 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms