Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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RRN3P1Q2M238 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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RRN3P1Q2M238 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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RRN3P1Q2M238 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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RRN3P1Q2M238 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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RRN3P1Q2M238 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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RRN3P1Q2M238 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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RRN3P1Q2M238 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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RRN3P1Q2M238 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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RRN3P1Q2M238 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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RRN3P1Q2M238 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RRN3P1Q2M238 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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