Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MICAQ29983 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MICAQ29983 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MICAQ29983 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MICAQ29983 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MICAQ29983 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MICAQ29983 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MICAQ29983 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MICAQ29983 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MICAQ29983 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MICAQ29983 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MICAQ29983 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MICAQ29983 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MICAQ29983 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MICAQ29983 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MICAQ29983 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MICAQ29983 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MICAQ29983 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MICAQ29983 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MICAQ29983 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MICAQ29983 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MICAQ29983 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MICAQ29983 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MICAQ29983 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MICAQ29983 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MICAQ29983 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MICAQ29983 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MICAQ29983 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MICAQ29983 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MICAQ29983 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MICAQ29983 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MICAQ29983 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MICAQ29983 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MICAQ29983 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MICAQ29983 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MICAQ29983 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MICAQ29983 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MICAQ29983 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MICAQ29983 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MICAQ29983 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MICAQ29983 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MICAQ29983 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MICAQ29983 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MICAQ29983 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MICAQ29983 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MICAQ29983 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MICAQ29983 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MICAQ29983 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MICAQ29983 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MICAQ29983 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MICAQ29983 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MICAQ29983 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MICAQ29983 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MICAQ29983 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MICAQ29983 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MICAQ29983 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MICAQ29983 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MICAQ29983 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MICAQ29983 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MICAQ29983 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MICAQ29983 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MICAQ29983 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MICAQ29983 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MICAQ29983 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MICAQ29983 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MICAQ29983 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MICAQ29983 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MICAQ29983 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MICAQ29983 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MICAQ29983 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MICAQ29983 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MICAQ29983 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MICAQ29983 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MICAQ29983 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MICAQ29983 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MICAQ29983 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MICAQ29983 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MICAQ29983 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MICAQ29983 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MICAQ29983 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MICAQ29983 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
MICAQ29983 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MICAQ29983 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MICAQ29983 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
MICAQ29983 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MICAQ29983 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MICAQ29983 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
MICAQ29983 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MICAQ29983 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MICAQ29983 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MICAQ29983 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MICAQ29983 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MICAQ29983 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MICAQ29983 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MICAQ29983 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MICAQ29983 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MICAQ29983 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MICAQ29983 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MICAQ29983 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MICAQ29983 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms