Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
COL24A1Q17RW2 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms