Protein–RNA interactions for Protein: Q16873

LTC4S, Leukotriene C4 synthase, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTC4SQ16873 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTC4SQ16873 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTC4SQ16873 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTC4SQ16873 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTC4SQ16873 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTC4SQ16873 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTC4SQ16873 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTC4SQ16873 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LTC4SQ16873 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTC4SQ16873 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTC4SQ16873 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTC4SQ16873 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTC4SQ16873 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LTC4SQ16873 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTC4SQ16873 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTC4SQ16873 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTC4SQ16873 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTC4SQ16873 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTC4SQ16873 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTC4SQ16873 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTC4SQ16873 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTC4SQ16873 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTC4SQ16873 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTC4SQ16873 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTC4SQ16873 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTC4SQ16873 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTC4SQ16873 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTC4SQ16873 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTC4SQ16873 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTC4SQ16873 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTC4SQ16873 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTC4SQ16873 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTC4SQ16873 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTC4SQ16873 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTC4SQ16873 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTC4SQ16873 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LTC4SQ16873 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTC4SQ16873 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTC4SQ16873 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTC4SQ16873 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTC4SQ16873 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTC4SQ16873 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LTC4SQ16873 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTC4SQ16873 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LTC4SQ16873 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LTC4SQ16873 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LTC4SQ16873 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LTC4SQ16873 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LTC4SQ16873 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LTC4SQ16873 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LTC4SQ16873 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTC4SQ16873 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTC4SQ16873 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTC4SQ16873 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTC4SQ16873 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTC4SQ16873 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTC4SQ16873 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTC4SQ16873 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTC4SQ16873 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTC4SQ16873 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTC4SQ16873 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTC4SQ16873 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTC4SQ16873 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTC4SQ16873 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTC4SQ16873 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LTC4SQ16873 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTC4SQ16873 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LTC4SQ16873 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTC4SQ16873 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LTC4SQ16873 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTC4SQ16873 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTC4SQ16873 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTC4SQ16873 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTC4SQ16873 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTC4SQ16873 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTC4SQ16873 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTC4SQ16873 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTC4SQ16873 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LTC4SQ16873 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTC4SQ16873 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTC4SQ16873 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTC4SQ16873 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTC4SQ16873 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTC4SQ16873 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTC4SQ16873 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTC4SQ16873 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTC4SQ16873 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTC4SQ16873 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTC4SQ16873 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTC4SQ16873 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTC4SQ16873 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTC4SQ16873 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTC4SQ16873 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTC4SQ16873 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LTC4SQ16873 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTC4SQ16873 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTC4SQ16873 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTC4SQ16873 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LTC4SQ16873 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LTC4SQ16873 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms