Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ME3Q16798 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ME3Q16798 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ME3Q16798 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ME3Q16798 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ME3Q16798 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ME3Q16798 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ME3Q16798 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ME3Q16798 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ME3Q16798 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ME3Q16798 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ME3Q16798 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ME3Q16798 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ME3Q16798 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ME3Q16798 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ME3Q16798 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ME3Q16798 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ME3Q16798 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ME3Q16798 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ME3Q16798 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ME3Q16798 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ME3Q16798 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ME3Q16798 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ME3Q16798 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ME3Q16798 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ME3Q16798 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ME3Q16798 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ME3Q16798 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ME3Q16798 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ME3Q16798 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ME3Q16798 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ME3Q16798 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ME3Q16798 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ME3Q16798 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ME3Q16798 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ME3Q16798 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ME3Q16798 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ME3Q16798 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ME3Q16798 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ME3Q16798 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ME3Q16798 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ME3Q16798 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ME3Q16798 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ME3Q16798 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ME3Q16798 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ME3Q16798 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ME3Q16798 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ME3Q16798 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ME3Q16798 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ME3Q16798 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ME3Q16798 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ME3Q16798 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ME3Q16798 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ME3Q16798 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ME3Q16798 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ME3Q16798 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ME3Q16798 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ME3Q16798 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ME3Q16798 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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ME3Q16798 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ME3Q16798 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ME3Q16798 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ME3Q16798 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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ME3Q16798 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ME3Q16798 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ME3Q16798 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ME3Q16798 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ME3Q16798 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ME3Q16798 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ME3Q16798 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ME3Q16798 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ME3Q16798 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ME3Q16798 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ME3Q16798 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ME3Q16798 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ME3Q16798 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ME3Q16798 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ME3Q16798 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ME3Q16798 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ME3Q16798 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ME3Q16798 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ME3Q16798 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ME3Q16798 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ME3Q16798 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ME3Q16798 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ME3Q16798 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ME3Q16798 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ME3Q16798 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ME3Q16798 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ME3Q16798 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ME3Q16798 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ME3Q16798 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ME3Q16798 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ME3Q16798 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ME3Q16798 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ME3Q16798 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ME3Q16798 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ME3Q16798 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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