Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
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