Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIST3H3Q16695 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms