Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZFHX3Q15911 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZFHX3Q15911 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms