Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VPS72Q15906 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
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