Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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