Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PDCD1Q15116 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDCD1Q15116 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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