Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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